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| 1917年 | （T6） | 9月 |
私立川崎商船学校を文部省認可 | |
| 1920年 | （T9） | 8月 |
官立神戸高等商船学校創立 航海科 30名、機関科 30名 |
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| 1927年 | （S2） | 1月 |
実習船「深江丸」進水式（初代深江丸） | |
| 1943年 | （S18） | 4月 |
清水高等専門学校設立 海技専門学院創設 |
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5月、8月
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爆撃により本館他焼失 | |||
| 1945年 | （S20） | 4月 |
高等商船学校（東京、清水）と統合し、高等商船学校設置 高等商船学校神戸分校および海技専門学院設置 |
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| 1946年 | （S21） | 5月 |
海技専門学院再開（泉佐野分教場） | |
| 1947年 | （S22） | 5月 |
深江教場使用再開 | |
| 1952年 | （S27） | 5月 |
国立学校神戸商船大学を設置 航海科 60名 機関科 60名（以下人数は入学定員の意） |
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| 1958年 | （S33） | 3月 |
実習船「深江丸」竣工（2代目） | |
| 1959年 | （S34） | 4月 |
航海科を航海学科に、機関科を機関学科に改称 航海学科70名 機関学科70名 |
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| 1962年 | （S37） | 4月 |
航海学科 80名 機関学科 80名 | |
| 1964年 | （S39） | 4月 |
神戸商船大学商船学専攻科開設 航海学専攻 10名 機関学専攻 10名 |
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| 1967年 | （S42） | 5月 |
練習船初代「進徳丸」を構内に設置 | |
9月 |
海事参考館を海事資料館に改称 | |||
| 1968年 | （S43） | 3月 |
実習船「深江丸」竣功（3代目） | |
| 1969年 | （S44） | 3月 |
学園紛争全学封鎖 | |
| 1972年 | （S47） | 4月 |
原子動力学科開設 40名 | |
5月 |
商船学部附属海洋実習施設設置（淡路島慶野松原） | |||
| 1973年 | （S48） | 4月 |
実習船「深江丸」が練習船「深江丸」へ配置換え | |
| 1974年 | （S49） | 6月 |
大学院商船学研究科（修士課程）設置（専攻科廃止） 航海学専攻15名 機関学専攻15名 |
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10月 |
第1回大学院入学式挙行 | |||
12月 |
修業年限が4年半から4年に改正（S51年入学者より適用） | |||
| 1977年 | （S52） | 4月 |
大学院商船学研究科に原子動力学専攻増設 8名 | |
| 1979年 | （S54） | 4月 |
航海学科を航海学科（60名）と輸送科学科（20名）に改組 | |
| 1980年 | （S55） | 4月 |
機関学科を機関学科（60名）と海洋機械管理学科（20名）に改組 乗船実習科設置 航海課程 80名、機関課程 120名 |
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| 1982年 | （S57） | 4月 |
女子学生の受入開始 | |
| 1983年 | （S58） | 4月 |
研究科航海学専攻を航海学専攻（10名）と輸送科学専攻（5名）に改組 乗船実習科入学定員 航海課程 60名 |
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| 1984年 | （S59） | 4月 |
研究科機関学専攻は機関学専攻（10名）と海洋機械管理学専攻（5名）に改組 乗船実習科入学定員 機関課程 100名 |
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| 1986年 | （S61） | 4月 |
学部入学定員改正 輸送科学科 25名、海洋機械管理学科 25名 |
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| 1987年 | （S62） | 4月 |
学部入学定員改正 輸送科学科 30名、海洋機械管理学科 30名 |
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10月 |
工場実習制度を廃止し、練習船実習に統合 練習船「深江丸」竣功（4代目） |
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| 1990年 | （H2） | 4月 |
商船学部 5学科を次の 4課程に改組 商船システム学課程 110名 輸送情報システム工学課程 40名 海洋電子機械工学課程 40名 動力システム工学課程 30名 |
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| 1991年 | （H3） | 9月 |
上海海運学院（現上海海事大学）と最初の学術交流協定 | |
| 1994年 | （H6） | 4月 |
商船学研究科 5専攻を次の 4専攻に改組 商船システム学専攻 8名 輸送情報システム工学専攻 8名 海洋電子機械工学専攻 11名 動力システム工学専攻 11名 |
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| 1995年 | （H7） | 1月 |
阪神・淡路大震災により、構内全般に被害を受ける （神戸商船大学学生 5名、研究者 1名が犠牲） |
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| 1997年 | （H9） | 4月 |
大学院商船学研究科（博士課程）設置 海上輸送システム科学専攻 4名 海洋機械エネルギー工学専攻 4名 |
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| 1998年 | （H10） | 4月 |
地域共同研究センター設置 | |
| 1999年 | （H11） | 4月 |
3年次編入学定員 10名 | |
| 2000年 | （H12） | 4月 |
学部入学定員改正 商船システム学課程 90名 | |
| 2003年 | （H15） | 10月 |
神戸商船大学と神戸大学が統合 海事科学部が設置され、次の 3 課程を設置 海事技術マネジメント学課程 90名 海上輸送システム学課程 50名 マリンエンジニアリング課程 60名 自然科学研究科に次の専攻を設置 博士課程前期課程 海事技術マネジメント学専攻 12名 海上輸送システム学専攻 16名 マリンエンジニアリング専攻 16名 博士課程後期課程 海事科学専攻 11名 海事科学部附属国際海事教育研究センター設置 附属図書館→神戸大学附属図書館海事科学分館 保健管理センター→神戸大学保健管理センター深江分室 地域共同研究センター→神戸大学連携創造センター深江地区 学部附属教育施設「船貨輸送研究施設」「海洋実習施設」廃止 野上智行神戸大学長が神戸商船大学長を併任 |
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| 2004年 | （H16） | 3月 |
神戸商船大学廃止 | |
4月 |
国立大学法人法により国立大学法人神戸大学となる 神戸商船大学商船学部及び大学院商船学研究科学生は、海事科学部及び自然科学研究科に移籍 |
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10月 |
海事資料館を海事博物館に改称 | |||
| 2007年 | （H19） | 4月 |
海事科学研究科が設置され、次の専攻を設置 博士課程前期課程 海事科学専攻 60名 博士課程後期課程 海事科学専攻 11名 |
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| 2008年 | （H20） | 4月 |
3 課程を 3 学科に改組 海事技術マネジメント学科 90名 海洋ロジスティクス科学科 50名 マリンエンジニアリング学科 60名 |
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